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Jan 10, 2024

Rapporti scientifici volume 13, numero articolo: 8972 (2023) Citare questo articolo

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Le modificazioni post-traduzionali (PTM) come l'acetilazione, la deubiquitinazione e la fosforilazione delle proteine, svolgono un ruolo importante in vari tipi di progressione del cancro. La proteinasi 5 specifica per l'ubiquitina (USP5), un membro unico degli enzimi deubiquitinanti (DUB) che riconosce specificamente la poliubiquitina non ancorata, potrebbe regolare la stabilità di molte proteine ​​associate alla tumorigenesi per influenzare l'inizio e la progressione del cancro. Tuttavia, il diverso significato biologico dell'USP5 nel cancro del pan non è stato studiato in modo sistematico e completo. Qui, abbiamo esplorato il ruolo dell'USP5 nel cancro del pan utilizzando il database Cancer Genome Atlas (TCGA) e Genotype-Tissue Expression (GTEx), e abbiamo anche acquisito e analizzato dati tramite vari software e piattaforme web come R, GEPIA2.0 , HPA, TISIDB, cBioPortal, UALCAN, TIMER 2.0, CancerSEA e BioGRID. L’espressione di USP5 era elevata nella maggior parte dei tumori e differiva significativamente nei diversi sottotipi molecolari e immunitari di tumori. Inoltre, l'USP5 aveva un certo valore diagnostico in più tumori e un'elevata espressione di USP5 generalmente prevedeva una prognosi sfavorevole per i pazienti affetti da cancro. Abbiamo anche scoperto che il tipo di alterazione genetica più frequente dell’USP5 era la mutazione e che il livello di metilazione del DNA dell’USP5 diminuiva in vari tumori. Inoltre, l'espressione di USP5 era correlata ai fibroblasti associati al cancro (CAF), alle cellule endoteliali (EC) e ai marcatori genetici degli immunodulatori nei tumori. Inoltre, il risultato del sequenziamento di singole cellule ha mostrato che l’USP5 potrebbe regolare diversi comportamenti biologici del tumore come l’apoptosi, il danno al DNA e la metastasi. L'analisi dell'arricchimento genetico ha indicato che lo "spliceosoma" e lo "splicing dell'RNA" potrebbero essere il meccanismo critico per il coinvolgimento dell'USP5 nel cancro. Nel loro insieme, il nostro studio chiarisce il significato biologico dell’USP5 nella diagnosi, nella prognosi e nel sistema immunitario nel cancro del pancreas umano.

Il cancro è una delle principali cause di morte umana, con notevoli impatti negativi sulla salute sociale e sull’economia in tutto il mondo1,2. Sebbene lo sviluppo della chirurgia, della chemioradioterapia, della terapia mirata e dell’immunoterapia abbiano migliorato l’effetto terapeutico sul cancro, la prognosi e il tasso di sopravvivenza dei pazienti affetti da cancro rimangono ancora infausti per molte ragioni, tra cui la resistenza ai farmaci e gli effetti collaterali3. Pertanto, l’identificazione di nuovi biomarcatori pan-tumorali e di bersagli terapeutici per il cancro è fondamentale per migliorare la salute umana 4.

La deubiquitinazione è una comune modificazione post-traduzionale (PTM) delle proteine, coinvolta nella regolazione di varie funzioni fisiologiche e processi patologici, come la trasduzione del segnale e la progressione del cancro5,6. La proteinasi ubiquitina specifica 5 (USP5), scoperta e purificata da Wilkinson et al., nota anche come ubiquitina isopeptidasi T (ISOT), appartiene alla famiglia delle proteinasi ubiquitina specifiche (USP), la più grande famiglia di enzimi deubiquitinanti (DUB) 7. USP5 si trova vicino al gene CD4 sul cromosoma umano 12p13 e codifica cinque domini separati con la dimensione di 93,3-kDa8. È unico in quanto può identificare e rimuovere specificamente l'ubiquitina dall'estremità prossimale delle catene di poliubiquitina non ancorate9. E molte ricerche dimostrano che l’USP5 regola una varietà di attività cellulari, tra cui la riparazione delle rotture del doppio filamento del DNA10, le risposte infiammatorie11 e le risposte allo stress12.

Per quanto riguarda il ruolo dell’USP5 nel cancro, recentemente ha attirato l’attenzione di molti ricercatori. Il collegamento funzionale tra l'espressione aberrante di USP5 e lo sviluppo di vari tumori come il cancro al seno13, il cancro del polmone14,15, il cancro del colon-retto16 e il carcinoma epatocellulare17 è stato stabilito da molti studi. Nel frattempo, è stato dimostrato che l'USP5 è strettamente correlato con alcune molecole chiave e percorsi che regolano il cancro, il che indica il valore potenziale dell'USP5 come nuovo bersaglio terapeutico per il cancro18. Tuttavia, il ruolo dettagliato dell’USP5 nel cancro del pan rimane finora sfuggente.

 0.7) in 20 cancer types, including ACC, BRCA, CESC, CHOL, COAD, DLBC, GBM, HNSC, KIRP, LGG, LIHC, LUAD, LUSC, OV, PAAD, READ, STAD, TGCT, THYM and UCS (Fig. 6A–T). Among them, USP5 had great diagnostic performance (the area under the curve > 0.9) in BRCA, CHOL, DLBC, LGG, LUSC, PAAD and THYM./p> 0.7) in 20 cancer types, especially in predicting BRCA, CHOL, DLBC, LGG, LUSC, PAAD and THYM (AUC > 0.9), indicating the potential clinical application value of USP5 as a reliable diagnostic biomarker. Meanwhile, as a unique member of deubiquitinating enzymes (DUBs), USP5 could manage the stability of some key tumor-regulating proteins such as, Hypoxia-inducible factor 2α (HIF2α) in BRCA13, CyclinD1 (CCND1) in GBM22, Snail Family Transcriptional Repressor 2 (SNAI2) in LIHC17, Histone Deacetylase 2 (HDAC2) in OV23, Signal Transducer And Activator Of Transcription 3 (STAT3)20, WT1 Transcription Factor (WT1)21 and Forkhead Box M1 (FOXM1)24 in PAAD and Catenin Beta 1 (CTNNB1)25, Programmed cell death ligand 1 (PD-L1)26 and CyclinD1 (CCND1)15 in NSCLC to promote cancer progression, and our receiver operator characteristic (ROC) curve analysis showed the area under the curve (AUC) of 0.905 in BRCA, 0.852 in GBM, 0.891 in LIHC, 0.820 in OV, 0.980 in PAAD and 0.946 in LUSC. Thus, the combination of USP5 with these tumor-related biomarkers separately may significantly improve the diagnostic accuracy for the above cancers. Using cox proportional hazards model and Kaplan–Meier analysis, we found that USP5 was negatively correlated with patients’ prognosis generally. Specifically, USP5 expression indicated poor overall survival in patients with LAML, LIHC, LUAD, MESO, SKCM and UVM. In addition, we further analyzed the association between the expression level of USP5 and disease-specific survival or progress-free interval of cancer patients, and we proved that on the whole, USP5 exhibited risk role in MESO and UVM for overall survival, disease-specific survival and progress-free interval, in LUAD and SKCM for overall survival and disease-specific survival and in COAD for disease-specific survival and progress-free interval. In addition to the previous reported negative association between USP5 and the progression of BRCA13, BLCA27, CRC16, GBM22, LIHC17, melanoma28, NSCLC15,26, OV23 and PAAD20, our result first showed that USP5 may emerge as a novel biomarker for predicting the prognosis of ACC, LAML and MESO, especially MESO. These results suggested that USP5 had important diagnostic and prognostic implications in various cancers, and may serve as a therapeutic target for precision oncology./p>